Po przeprowadzonej w latach 1995-2005 inwentaryzacji faunistycznej tych terenów Małopolskie Koło TP Bocian wytypowało 3 obszary najbardziej cenne, których przyroda jest lub może być zagrożona. W lutym 2006 r. zgłoszono do Urzędu Wojewódzkiego w Krakowie wnioski o objęcie formą ochrony tych miejsc:

- lasu łęgowego w ujściu Stradomki do Raby

- dolinki dopływu Tarnawki na Pogórzu Wiśnickim

- regla górnego i buczyn na północnym i wschodnim stoku Mogielicy

W sierpniu 2006 r. odbyła się wizja lokalna w ujściu Stradomki z udziałem przedstawcieli WKP, Instytutu Ochrony Przyrody (IOP) PAN, Regionalnego Zarządu Gospodarki Wodnej w Krakowie, Urzędu Gminy w Gdowie i TP Bocian. Ustalono, że najodpowiedniejszą formą ochrony na tym terenie będzie utworzenie użytku ekologicznego, nastawionego na ochronę tamtejszej awifauny i jej nadrzecznych siedlisk. Jednakże z uwagi na skomplikowaną formę własności tego terenu urzędnicy WKP zrezygnowali z dalszych starań o utworzenie tam jakiejkolwiek formy ochrony przyrody.

Propozycja utworzenie rezerwatu nad Tarnawką nigdy nie została rozpatrzona przez WKP ani obecną Regionalną Dyrekcję Ochrony Środowiska w Krakowie. Nie odbyła się w tym terenie nawet wizja lokalna.

Natomiast sprawa rezerwatu na Mogielicy przedstawiała się następująco:
W czerwcu 2006 r. członkowie TP Bocian w trakcie obozu zorganizowanego na Mogielicy wykonali inwentaryzację florystyczną i fitosocjologiczną. Wyniki tej inwentaryzacji i wcześniejszych badań ornitologicznych zostały wykorzystane do opracowania projektu złożonego z początkiem 2007 r. do WKP i Regionalnej Dyrekcji Lasów Państwowych (RDLP) w Krakowie. Zaproponowano by na kopule Mogielicy utworzyć 65 ha rezerwat ornitologiczny, głównie dla ochrony subpopulacji głuszca Tetrao urogallus. W latach 2007-2008 r. zasięgnięto opinii Nadleśnictwa Limanowa, Gorczańskiego PN oraz władz lokalnych na temat proponowanej formy i granic rezerwatu. Jedynie opinia gminy Słopnice była negatywna. W 2008 r. doszło do "zagubienia" projektu rezerwatu u WKP w Krakowie, jednak dostarczono kopie tego projektu. Jesienią 2009 r. doszło do spotkania wszystkich zainteresowanych stron (pomysłodawców projektu, urzędników Regionalnej Dyrekcji Ochrony Środowiska (RDOŚ), pracownika IOP PAN, leśników z Nadleśnictwa Limanowa i urzędników z gmin Dobra i Słopnice) w Limanowej i na Mogielicy. W toku rozmów zdecydowano o korekcie granic rezerwatu, odejmując od niego wschodniej oddziały kolidujące z planami inwestycyjnymi gminy Słopnice (planowany wyciąg narciarski). 8 grudnia 2009 r. Regionalna Rada Ochrony Przyrody w Krakowie pozytywnie zaopiniowała projekt utworzenia rezerwatu "Mogielica" proponując by miał on statut faunistyczno-florystyczno-geologiczny. Do utworzenia rezerwatu konieczny jest obecnie tylko podpis Dyrektora RDOŚ w Krakowie...

Ponadto ochroną powinny być objęte jeszcze następujące inne miejsca (tutaj wymienione głównie z terenu Podgórza Bocheńskiego z Doliną Raby, Pogórza Wielicko-Wiśnickiego, Beskidu Wyspowego oraz pojedyncze z Niziny Nadwiślańskiej, doliny Dunajca, Gorców i Beskidu Średniego):

1- starorzecze w Kłaju (dolina Raby)
2- stare wyrobisko i las łęgowy w Winiarach (dolina Raby)
3- zatoka Wolnica (dolina Raby)
4- cofka zb. Dobczyckiego (dolina Raby)
5- bagienny bór sosnowy i ols w lesie Leśniówka w Jawczycach (Podgórze Bocheńskie)
6- bagienna dolina Królewskiego Potoku (Podgórze Bocheńskie)
7- dąbrowa w Cichawie (Podgórze Bocheńskie)
8- suche pastwiska i dąbrowy w Buczkowie (Podgórze Bocheńskie)
9- dolina w lesie Bronaczowa k. Raciechowic (Pogórze Wielickie)
10- grąd w Biskupicach (Pogórze Wielickie)
11- podgórska dolina Kamyka i jego dopływu w Grajowie i Rudniku (Pogórze Wielickie)
12- kserotermiczne wzgórza w Moszczenicy (Pogórze Wiśnickie)
13- kserotermiczna góra Borek w Stradomce (Pogórze Wiśnickie)
14- dolina Krzyworzeki k. Skrzynki (Pogórze Wiśnickie)
15- łęgi i olsy w środkowym biegu Stradomki i dolnym Tarnawki (Pogórze Wiśnickie)
16- przełom Tarnawki (Pogórze Wiśnickie)
17- źródlisko Sanki i jedliny na zboczach (Pogórze Wiśnickie)
18- dolina Przeginii (Pogórze Wiśnickie)
19- dolina Uszwicy i Piekarska Góra (Pogórze Wiśnickie)
20- kamieniołomy, dolinki, młaki i kserotermy w Pieninkach Skrzydlańskich (Beskid Wyspowy)
21- las łęgowy, koryto rzeczne i torfowiska w dolinie Czarnej Rzeki w Słopnicach (Beskid Wyspowy)
22- świerczyny i polana na Ćwilinie (Beskid Wyspowy)
23- jedliny, polany i bagno na Łopieniu (Beskid Wyspowy)
24- buczyny, źródlisko Łososiny i polany na Jasieniu-Kobylicy (Beskid Wyspowy)
25- polana, buczyny i jedliny na Mogielicy (Beskid Wyspowy)
26- torfowisko i rumowisko skalne na Ćwilinie (Beskid Wyspowy)
27- torfowisko i skały na Krzysztanowie (Beskid Wyspowy)
28- jaworzyna na Lubogoszczy (Beskid Wyspowy)
29- bór mieszany i buczyny oraz wychodnie skalne na Strzeblu (Beskid Wyspowy)
30- górska dolina Łososiny między Podłopieniem a Łososiną Górną (Beskid Wyspowy)
31- buczyna i skały na Grodzisku (Beskid Wyspowy)
32- buczyny, polany i jaskinie w Paśmie Łososińskim (Beskid Wyspowy)
33- skarpa w Hebdowie (Nizina Nadwiślańska)
34- skarpa w Morsku-Witowie (Nizina Nadwiślańska)
35- podmokłe łąki k. Ujścia Solnego (Nizina Nadwiślańska)
36 - torfowisko Wielkie Błoto (Puszcza Niepołomicka)
37- cofka i wyspa na zbiorniku Czchowskim (Dolina Dunajca)
38- cofka i wyspy na zbiorniku Rożnowskim (Dolina Dunajca)
39- lasy i polany na Kotoniu (Beskid Średni)
40- buczyny i polany w Paśmie Lubomira i Łysiny (Beskid Średni)
41- bór i borówczyska na Gorcu (Gorce)
42- bór i polany w Paśmie Lubania (Gorce)

Lokalizacje wymienionych wyżej proponowanych form ochrony przyrody można zobaczyć na mapie (liczby na mapie odpowiadają numerom wymienionym powyżej).